class: center, middle, inverse, title-slide # Pesquisa e colaboração durante a pandemia de Covid-19 ### Andrea Sánchez-Tapia ### Ciência com Certeza
INPA - Manaus ### 2 de julho de 2020 --- ### Apresentação + Bióloga - Universidade Nacional da Colômbia + Mestre em Ecologia - UFRJ + Doutora em Botânica - JBRJ + .purple[Pós-doc - Núcleo de Computação Científica e Geoprocessamento do JBRJ (Marinez Ferreira de Siqueira)] Ecologia de comunidades vegetais, restauração ecológica, ecologia quantitativa __Informática da biodiversidade__, modelagem de nicho ecológico __Ciência aberta e reprodutível__, ética na ciência de dados, ciência de dados feminista --- background-image: url("figs/coleguinhes.png") background-position: 68% 64% background-size: 600px ## Pacote de R para modelagem de nicho ecológico: .red[modleR] + __Unificar__ diferentes partes do processo de MNE + Fornecer __metadados__ e __documentar__ decisões de parametrização + Se __integrar__ ao resto de ferramentas que existem no ambiente de `R` <br> <img src="./figs/mm.png" width="150" /> <small> Marinez F Siqueira, Sara Mortara, Diogo Rocha, Guilherme Gall, Felipe Sodré </small> .pull-left[
<small> [https://model-r.github.io/modleR/](https://model-r.github.io/modleR/) </small> ] .pull-right[ <p style="text-align:center;">
<a href="https://www.youtube.com/watch?v=4Xw33TdIVXA">Aula no curso ENM-2020</a> </p> ] --- class: bottom, center background-image: url("figs/modleR.png") background-position: 50% 0% background-size: 800px <img src="./figs/preprint.png" width="800" /> --- #### A MNE não deve ser usada para modelar a distribuição da pandemia .purple[`#spoileralert`] <center> <img src="./figs/tuit.png" width="500" /> </center> --- background-image: url("figs/logo_jbrj.png") background-position: 98% 5% background-size: 100px <!-- + "Curso de `R`" : ensino de ferramentas de computação científica `R` <br> --> ### Curso sobre ciência aberta e fluxos de trabalho reprodutíveis #### (Um curso de `R` sqn) .pull-left[ <img src="./figs/turma.JPG" width="320" /> Turma 2020 :) ] .pull-right[ __Boas práticas__ em análise de dados <img src="./figs/rstudio.jpg" width="200" /> <img src="./figs/logo-git.png" width="80" /><img src="./figs/GitHub_Logo.png" width="80" /><img src="./figs/btibucket.png" width="80" /><img src="./figs/gitlab-logo-gray-rgb.png" width="80" /> <img src="./figs/latex.jpeg" width="100" /><img src="./figs/bibtex.jpeg" width="100" /><img src="./figs/zotero.svg" width="100" /> <img src="./figs/rmarkdown.png" width="50" /> ] <!-- pensada como seminário alunes de várias áreas do conhecimento ferramentas que não têm um ensino formal de grande utilidade --> --- class: center, middle, inverse # Durante a pandemia --- background-image: url("figs/coronabr.png") background-position: 50% 90% background-size: 700px ## Pacote [.red[coronabr]](https://liibre.github.io/coronabr/index.html) + __Disponibilizar__ os dados do Ministério da Saúde, [Brasil I/O](https://brasil.io/dataset/covid19/caso), John Hopkins + Sem análises, projeções ou modelos <!-- dois colegas de longa data --> --- class: middle background-image: url("figs/obs.png") background-position: 90% 5% background-size: 150px <!-- + Criado 14/03/2020 (UNESP, USP, UFABC). + Hoje >40 pesquisadores (modelagem estatística, análises socioeconômicas, epidemiologia, divulgação científica) + Notas técnicas, suporte à tomada de decisão + Parcerias locais com Secretarias de Saúde --> <img src="./figs/obsprint.png" width="950" /> .pull-left[
.blue[@obscovid19br] ] .pull-right[
.blue[covid19br.github.io] ] --- background-image: url("figs/ridge.png") background-position: 100% 60% background-size: 530px <!-- + Mais de 40 pesquisadores com diferentes formações e habilidades (epidemologia, modelagem estatística, análises socio-econômica, divulgação científica, criação de conteúdo pedagógico...) --> #### Grupo de __correção de atrasos__ na notificação por "nowcasting" bayesiano (McGough _et al._ 2020) <!-- Data do início dos sintomas Data da notificação de que o exame deu positivo Data do óbito Data da notificação do óbito --> .pull-left[ <img src="figs/obito.png" width="300" /> #### (Notificação: 27/06/2020) ] .pull-right[ ] --- class: center, middle #### Tabatinga (AM) (fonte: SIVEP - Nacional 30/06/2020) .pull-left[ <small> COVID-19 </small> ] .pull-right[ <small> Síndrome Respiratória Aguda Grave (SRAG) </small> ] <img src="figs/tabatinga/plot_nowcast_covid.svg" width="300" /><img src="figs/tabatinga/plot_nowcast_srag.svg" width="300" /><img src="figs/tabatinga/plot_nowcast_cum_covid.svg" width="300" /><img src="figs/tabatinga/plot_nowcast_cum_srag.svg" width="300" /> --- class: center, middle # ¡Gracias!
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[@SanchezTapiaA](https://twitter.com/SanchezTapiaA)
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